舞台是浅草。初中二年级的矢逆一稀、久慈悠、阵内燕太三人，某天遇到了神秘的河童型生命体“Keppi”，并被强行夺走了尻子玉而变成了河童。 “想要变回原状的话，就通过‘某个方法’产生联系，并把僵尸的尻子玉拿来吧”。Keppi如此告知三人。究竟少年们能否相互产生联系，并夺取僵尸的尻子玉呢？！与此同时，新星玲央和阿久津真武执勤的派出所，似乎也发生了什么。
过去，在被称作冬木的城市曾举行过由七位魔术师与英灵参加的“圣杯战争”。 然而趁着第二次世界大战的混乱，“某位魔术师”强行夺走了圣杯—— 数十年过去，千界树一族高举那个圣杯为象征，叛离了魔术协会，宣布独立。 愤怒的魔术协会派遣了刺客，但他们却遭到了召唤出的Servant的反击。
千世炉鼎叶言，这一世重生为云烟派掌门的亲传弟子，其实是圈养的炉鼎，在即将被采补的时候系统觉醒，获得新手礼包，得到一瓶可以短时间内强行提升修为的暴灵丹、一颗元婴丹、两层的练气修为。系统发布任务——逃离师门
在宇宙的某个角落，隐藏着一所秘密医学试验机构，这里的实验对象与众不同，是人类。科学家们想要无限开发出人类的潜能，改变人类的未来，所以他们叫这里未来城。与其说是未来城，不如说是监狱更为贴切。这里的被实验者源自于世界各地，他们身上都掩藏着可怕的秘密，说是极恶也不为过。人体研究实验进入瓶颈，由于陆崇生的反抗意识太强，实验无法突破，如果不能突破陆崇生的意志力，深层大脑开发无法进行。教授试图强行突破，竟然造成整个试验系统的崩溃，此前的所有努力全付诸流水.......