少年师爷讲述的是初到江南游玩的小太子在机缘巧合下来到了水乡绍兴，结识了小师爷、小越、丁丁、钱贯等小伙伴，展开了一段段稀奇古怪、啼笑皆非的小故事。故事中作为智慧和正义的代表——小师爷，通过自己的力量处处替人排忧解难，博得邻里乡亲的交口称赞。而成为一名顶天立地、为国为民的大师爷更是他从小的梦想。
该剧讲述沈倾眉女扮男装成为橘井县县令，谢临舟意外失忆化身冷面师爷；从人人喊打的昏官到交口称赞的青天，他们一本正经地上演了一幕又一幕的啼笑皆非；随着两人默契合作，情愫渐生，谢临舟心动之后却被告知，作为杀手，他失忆前的最后一个目标，正是沈倾眉！