本剧通过刘三姐不平凡的经历，不为人知的故事，讲述了刘三姐的传奇故事，展现了广西的民风民情和秀美的大好河山。刘三姐是民间歌手，乐于助人，聪明美丽，她巧断葫芦案，解救使女香草，用“鹦鹉偷簪”、“巧断猫案”，智斗贪官县令。她在柳州传歌，去邕城参加南国歌会，又“矮人寨智救逃婚妹”、“风雨桥同唱礼仪歌”。在大唐特使召见时，大唱“警世真歌”，为民请命，为民代言。土司桂万山、秀才张伟望、阿龙等人帮助三姐渡过重重难关。而对三姐怀恨在心，一心报复的慕仁环则用尽阴谋诡计，迫害三姐，最后被一一击败，落得可耻下场。
韦文德（苏有朋 饰）是一名音乐家，某日，他演奏了老电影《刘三姐》中的插曲，被导师听到，导师告诉韦文德，尽管他的技艺已经炉火纯青，所弹奏了曲子却缺少最重要的东西——灵魂。为了寻找灵魂，韦文德决定回到故乡广西，在那里探寻有关刘三姐的轶事。
刘三姐（付锦华 饰）在返乡途中偶遇财主莫海仁的管家莫进财欺负猎户李小牛，脾气火爆的刘三姐挺身而出，靠着自己的智慧赶走了莫进财，就此两人相识相知，渐渐走到了一起。贪婪的莫海仁一直都在打着霸占茶山的主意，这一天，他又派人前往茶山捣乱，又是刘三姐机智的破解了莫海仁的阴谋诡计。
《小戏骨：刘三姐》是在1960年电影《刘三姐》的基础之上精编而成，保留了原版《刘三姐》中的主要情节，并且着重演绎了“水边赛歌”的情节。